醍狭AV

慧濔プロジェクト冩梢センタ`

センタ`児云デ`タ

  • 屁尖桑催19-03
  • 譜崔豚寂2007定10埖01晩゛2025定03埖31晩
  • センタ`L侭奉/兆/箆兆佐麪г砂y栽伏凋親僥冩梢親 / 縮娩 / 残寒 t嵶
  • Bj枠TEL / E-mail082-424-7767 / karakawa[AT]hiroshima-u.ac.jp─[AT]は磯叔世勃辰Qえてください

プロジェクト古勣

朕議

慧醸は、1)圻宰伏麗であるにもかかわらず彜半弼悶をもち、2)カビに貌た}jな侘B蛍晒を佩い、3)森伏麗|を兜め謹くの嗤喘な屈肝旗xb麗を伏bするという蒙罿鬚發Oめて蒙議な裏伏麗である。2007定に云プロジェクトセンタ`をO羨した直蝉慎縮娩は、慧醸から賞寄彜プラスミドをkし、Aいて彜半弼悶のダイナミックな夛篁を盾裂して、弊順における慧醸のゲノム冩梢をリ`ドしてきた。云プロジェクトセンタ`の3定gの撹惚として、森伏麗|伏栽撹?屈肝旗xカスケ`ドの盾裂を嶄伉にした圻广猟を9鶲k燕した。その嶄には2009定ノ`ベル晒僥p鞭p宀Ada Yonath鴬平との慌广猟もあり、慧醸の互い屈肝旗x嬬が弊順嶄で廣朕されている採よりの^である。
慧醸ゲノムの冩梢は、仝圻宰伏麗はh彜半弼悶をもつ々というz姿Г離疋哀泙鮓欧靴燭海箸砲茲辰董伏麗僥に寄きなインパクトを嚥えた。また半弼悶がh彜から彜へM晒したメカニズムについても嶷勣な岑をもたらした。さらに、暴たちがF壓、薦を秘れている屈肝旗x崙囮カスケ`ドの盾裂は、伏麗(慧醸) がいかに派虫に森伏|伏bや飲徨侘撹を崙囮しているかを苧らかにしつつある。書瘁も云プロジェクトセンタ`を@Aし、慧醸冩梢を謹叔議にk婢させていく 侭贋である。
 

嘘尚

森伏麗|伏bへのプラスミドのv嚥が硬くから蟹えられてきたが、その麗尖議g悶はLいg音苧であった。暴たちはパルスフィ`ルド殲咾魴転醸DNAに兜めてm喘して、謹くの森伏麗|伏b醸から彜プラスミドを奮し、蒙に、S. coelicolorのメチレノマイシン伏bにv嚥するSCP1が350kbの賞寄彜プラスミドであることを苧らかにした(Nature, 328, 454 (1987))。このkはその瘁、肝の2つの圭鬚愆鵑くk婢した。 1) ChenらはS. lividansの半弼悶徭附が彜であることを苧らかにし、暴たちによるS. griseusの箭を根めて謹くの慧醸幄から彜半弼悶が奮された。こうして仝圻宰伏麗はh彜半弼悶をもつ々というz姿Г粒WRは顕された。Aいて暴たちは、S. griseusの彜半弼悶が挑極之払に育ってh彜晒やア`ム崔Qを軟こすこと、彜プラスミドと匯泣住餓してキメラ半弼悶を侘撹することを苧らかにした。このようなY惚は、仝寄c醸侏のh彜半弼悶と彜プラスミドが匯泣住餓して彜半弼悶が伏まれ、彜半弼悶揖平あるいは彜半弼悶と彜プラスミドが 匯泣住餓して彜半弼悶の}方晒が軟こった々ことをく幣又した。 2) SCP1のkにAいてpSLA2-Lの畠c児塘双をQ協し、その貧にランカサイジン、ランカマイシン、カロテノイドの伏栽撹クラスタ`および謹くの崙囮z思咾鰺協した。ランカサイジンの伏栽撹はOめて蒙議であり、謹くの崙囮z思咾湾}jな屈肝旗x崙囮カスケ`ドを撹していることが蛍かった。このg、麿のグル`プからはほとんど鷂罎なかったが、恷除になってneocarzinostatin, leinamycin, C-1027, lasalocid, echinomycin, chlorothricin吉の伏栽撹クラスタ`が彜プラスミド貧にコ`ドされていることが苧らかになった。また、啓穽綮栽麗の蛍盾や峅麗押圻來へのv嚥も鷂罎気譴董⊂彜プラスミドが裏伏麗の屈肝旗xにレくvわっていることが肝及に苧らかになってきた。
 

冩梢柴鮫

峠撹22定業
(1) 彜レプリコンのc児塘双盾裂に児づいたゲノム夛にvする冩梢
?S. rochei 7434AN4幄の彜半弼悶の畠c児塘双Q協
 ─ 峠撹23,24定業も@Aして冩梢

(2) S.rocheiの森伏麗|伏栽撹?飲徨侘撹および屈肝旗x崙囮カスケ`ドの盾裂
?晦遺伏栽撹におけるモジュラ`?郡畯貂椀猶憤皆の盾裂
?晦遺桟晒粛殆晦一界掘の蛍徨範紛字更盾裂
?屈肝旗仍崙囮シグナルカスケ`ドの利袋議盾裂
 ─ 峠撹23,24定業も@Aして冩梢

(3) ジャガイモそうか押の蛍徨伏麗僥議盾裂とその鮄
?仟たな押圻麗嵎の更夛と字嬬の盾裂

峠撹23定業參週の柴鮫
(1) 彜レプリコンのc児塘双盾裂に児づいたゲノム夛にvする冩梢
?S. rochei 7434AN4幄の彜半弼悶の畠c児塘双Q協
 ─ 峠撹22定業から@A
?炯乾廛薀好潺姫莖С粥2-晦,-珂,-皆の伏撹字更の盾裂
?炯乾肇櫂蹈県`を隠隔する咀徨の冥沫

(2) S.rocheiの森伏麗|伏栽撹?飲徨侘撹および屈肝旗x崙囮カスケ`ドの盾裂
?屈肝旗仍崙囮シグナルカスケ`ドの利袋議盾裂─ 峠撹22定業から@A
?互字嬬蛍徨更廏を朕峺した晦珂伏栽撹粛殆の字嬬盾裂
?7434粥鰻4幄における飲徨侘撹字更の盾苧

麼な並匍試強

僥氏k燕參翌の試強を參和に芝す。
?晩云慧濔僥氏2007定業寄氏硫祇を麼岸2007
?晩云慧濔僥氏浜を鞭浜2007
?ゲノムひろば2007 in寄昜に歌紗2007
?牽表寄僥グリ`ンサイエンス冩梢センタ`及4指巷蝕讐處氏で讐處2007
?ミニゲノムひろば2007 in牽に歌紗2007
?及17指臼戦冩梢侭僥氏浜鞭浜宀蒙艶讐處氏で讐處2008

麼な冩梢撹惚

麼なk燕胎猟は肝の宥りである。
?S. Yamamoto et al.: g-Butyrolactone-dependent expression of the SARP gene srrY plays a central role in the regulatory cascade leading to lankacidin and lankamycin production in Streptomyces rochei. J. Bacteriol., 190, 1308-1316 (2008)
?K. Arakawa et al.: Cyclization mechanism for the synthesis of macrocyclic antibiotic lankacidin in Streptomyces rochei. Chem. Biol., 12, 249-56 (2005)
?M. Yamasaki and H. Kinashi: Two chimeric chromosomes of Streptomyces coelicolor A3(2) generated by single crossover of the wild-type chromosome and linear plasmid SCP1. J. Bacteriol., 186, 6553-59 (2004)
?S. Mochizuki et al.: The large linear plasmid pSLA2-L of Streptomyces rochei has an unusually condensed gene organization for secondary metabolism. Mol. Microbiol., 48, 1501-10 (2003)
?D. Kameoka et al.: Analysis of fusion junctions of circularized chromosomes in Streptomyces griseus. J. Bacteriol., 181, 5711-17 (1999)
?M. Redenbach et al.: A set of ordered cosmids and a detailed genetic and physical map for the 8 Mb Streptomyces coelicolor A3(2) chromosome. Mol. Microbiol., 21, 77-96 (1996)
?A. Lezhava et al.: Physical map of the linear chromosome of Streptomyces griseus. J. Bacteriol., 177, 6492-98 (1995)
?H. Kinashi and M. Shimaji-Murayama: Physical characterization of SCP1, a giant linear plasmid from Streptomyces coelicolor. J. Bacteriol., 173, 1523-29 (1991)
?H. Kinashi et al.: Giant linear plasmids in Streptomyces which code for antibiotic biosynthesis genes. Nature, 328, 454-56 (1987)
?H. Kinashi and M. Shimaji: Detection of giant linear plasmids in antibiotic producing strains of Streptomyce by the OFAGE technique. J. Antibiot., 40, 913-16 (1987)


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